4月10日，清华大学官网公布了2021年度部门预算。清华大学2021年收支总预算为3,172,831.47万元。与2020年相比，收支总预算增加65,666.75万元。
预算文件显示，清华大学2021年收入预算中，上年结转884,712.49万元，主要是2020年未完科研项目本年按照原规定用途继续使用的资金；本年收入预算 2,288,118.98万元，一般公共预算拨款436,537.59万元，占收入预算的19.08%；政府性基金预算拨款8,405.00万元，占收入预算的0.37%；非财政拨款性收入 1,843,176.39万元，占收入预算的80.55%，其中事业收入1,264,952.28 万元，占收入预算的55.28%，其他收入578,224.11万元，占收入预算的25.27%。
学校2021年支出预算2,424,481.31万元，其中基本支出1,216,195.26万元，占支出预算的50.16%；项目支出1,208,286.05万元，占支出预算的49.84%。按照支出功能科目划分，外交支出240.00万元，占支出预算的0.01%；一般行政管理事务27.00万元；小学教育9,509.00万元，占支出预算的0.39%；高中教育 44,371.00万元，占支出预算的1.83%；高等教育2,035,239.84万元，占支出预算的83.95%；来华留学教育6,227.84万元，占支出预算的0.26%；教师进修80.00万元；其他教育支出3,031.34万元，占支出预算的0.13%；科学技术支出81,353.47万元，占支出预算的3.36%；社会保障和就业支出33,799.64万元，占支出预算的1.39%；卫生健康支出166,640.73万元，占支出预算的6.87%；交通运输支出44.00万元；资源勘探工业信息等支出957.59万元，占支出预算的0.04%；住房保障支出42,959.86万元，占支出预算的1.77%。
